বাংলাদেশের জাতীয় স্বাধীন তদন্ত কমিশনের সাম্প্রতিক প্রতিবেদনে ২০০৯ সালের বিডিআর বিদ্রোহ ও পিলখানা হত্যাকাণ্ডে কয়েকজন সেনা কর্মকর্তার সম্পৃক্ততার নতুন প্রমাণ উঠে এসেছে। প্রতিবেদনে ১৪ নম্বর কয়েদি সাক্ষীর জবানবন্দিতে বলা হয়েছে, হত্যাকাণ্ডের আগের দিন ২৪ ফেব্রুয়ারি ২০০৯ সন্ধ্যায় ৪৪ রাইফেল ব্যাটালিয়নের মাঠে এক গোপন বৈঠকে বিদ্রোহী সৈন্যরা কর্মকর্তাদের জিম্মি করার পরিকল্পনা করে। তারা রশি ও চাকু নিয়ে প্রস্তুত থাকার সিদ্ধান্ত নেয়। ৬৫ নম্বর সাক্ষীর বর্ণনায় জানা যায়, তিনটি ব্যাটালিয়নের অস্ত্র সেন্ট্রাল কোয়ার্টার গার্ডে সংরক্ষিত ছিল এবং ঘটনার কয়েক দিন আগে থেকেই কর্মকর্তারা সেখানে ডিউটিতে ছিলেন। ২৫ ও ২৬ ফেব্রুয়ারি সংঘটিত এই বিদ্রোহে ৫৭ সেনা কর্মকর্তা নিহত হন। ১১ মাসের তদন্ত শেষে কমিশন প্রধান উপদেষ্টার কাছে প্রতিবেদন জমা দিয়েছে, যা বাংলাদেশের ইতিহাসের এক কলঙ্কজনক অধ্যায়ে নতুন তথ্য উন্মোচন করেছে।