যুক্তরাষ্ট্রের USCIRF-এর বার্ষিক প্রতিবেদনের বিরুদ্ধে তীব্র প্রতিক্রিয়া জানিয়েছে ভারত। ভারতের পররাষ্ট্র মন্ত্রণালয় জানিয়েছে, এই কমিশনের "বিচারিক পক্ষপাতদুষ্টতা ও রাজনৈতিক উদ্দেশ্যপ্রণোদিত মূল্যায়ন’-এর জন্য এটিকে আন্তর্জাতিকভাবে ‘একটি সংকটজনক সত্তা’ হিসেবে ঘোষণা করা উচিত।'' মার্কিন ফেডারেল কমিশনের সর্বশেষ প্রতিবেদনে ভারতে সংখ্যালঘুদের প্রতি বৈষম্য ও নিপীড়নের অভিযোগ আনা হয়েছে। এছাড়া ভারতের বৈদেশিক গোয়েন্দা সংস্থা RAW-এর বিরুদ্ধে বিদেশে ‘খালিস্তানি’ বিচ্ছিন্নতাবাদীদের হত্যাচেষ্টা চালানোর অভিযোগ তুলে এই সংস্থার ওপর নিষেধাজ্ঞা আরোপের আহ্বান জানিয়েছে।