ডক্টর ইউনূস সরকারের অধীনে বাংলাদেশে রাজনৈতিক সংস্কারের অগ্রগতি হলেও ধর্মীয় স্বাধীনতা নিয়ে এখনো উদ্বেগ রয়ে গেছে বলে দাবি করেছে যুক্তরাষ্ট্রের আন্তর্জাতিক ধর্মীয় স্বাধীনতা কমিশন। প্রতিবেদনে বলা হয়েছে, সংবিধানে ধর্মীয় স্বাধীনতার নিশ্চয়তা থাকলেও বাংলাদেশ এখনো দণ্ডবিধির ১৯৫এ ধারার আওতায় ধর্ম অবমাননার আইন বজায় রেখেছে। পাশাপাশি ২০২৩ সালের সাইবার নিরাপত্তা আইনের কিছু ধারা এমন কনটেন্টকে (আধেয়) অপরাধ হিসেবে গণ্য করে, যা ধর্মীয় অনুভূতিতে আঘাত হানতে পারে। প্রতিবেদনে বিএনপিকেও জামায়াতের সাথে সংশ্লিষ্ট উল্লেখ করে রক্ষণশীল হিসেবে দাবি করা হয়েছে, এবং সংবিধানে আল্লাহর ওপর পূর্ণ আস্থা ও বিশ্বাস যুক্ত করার বিএনপির দাবিকে উল্লেখ করা হয়েছে। আরও বলা হয়, বিশ্ববিদ্যালয় ক্যাম্পাসগুলোতে রক্ষণশীল ইসলামপন্থী মতাদর্শের উপস্থিতি আগের তুলনায় দৃশ্যমানভাবে বেড়েছে বলে কিছু নারী অভিযোগ করেছেন। এছাড়া নারী কমিশনের বাঁধার সম্মুখীন হওয়াকে উল্লেখ করা হয়।