বাংলাদেশ আবহাওয়া অধিদপ্তর জনবল ঘাটতি, দীর্ঘ পদোন্নতিজট, পুরোনো প্রযুক্তি ও বাজেট কমার মধ্যে সংকটে রয়েছে বলে প্রতিবেদনে বলা হয়েছে। ১৬ আগস্ট ২০২৬ প্রকাশিত প্রতিবেদনে জানানো হয়, দুর্যোগের আগাম সতর্কবার্তা দেওয়ার দায়িত্বে থাকা সংস্থাটির নতুন অর্গানোগ্রামে ১,৩৩৮টি পদ থাকলেও কর্মরত আছেন মাত্র ৫৫৭ জন। দেশের বহু পর্যবেক্ষণ কেন্দ্র এবং গুরুত্বপূর্ণ বিভাগ ভারপ্রাপ্ত কর্মকর্তা বা অতি সীমিত জনবল দিয়ে পরিচালিত হচ্ছে।
আট বিভাগীয় কার্যালয়ের অধীনে ৬১টি পর্যবেক্ষণাগারের মধ্যে ২৪টি কেন্দ্রে মাত্র এক থেকে তিনজন কর্মী আছেন। ২৪ ঘণ্টার কেন্দ্রগুলোতে তিন শিফটে কাজ চালাতে ন্যূনতম ১০ জন প্রয়োজন হলেও বাস্তব চিত্র ভিন্ন। ২০১৩ সাল থেকে নিয়োগ ও পদোন্নতি বন্ধ থাকার কথাও কর্মকর্তারা বলেছেন। শীর্ষ নেতৃত্বের পদমর্যাদা ও কারিগরি কর্মকর্তাদের বদলে প্রশাসন ক্যাডারের কর্মকর্তাদের দিয়ে পদ পূরণের চেষ্টা নিয়েও সংশ্লিষ্টদের আপত্তি রয়েছে।
২০২৬-২৭ অর্থবছরে অধিদপ্তরের বরাদ্দ আগের বছরের ১০৯ কোটি ১৯ লাখ টাকা থেকে কমে ৯৯ কোটি ৫১ লাখ ৭২ হাজার টাকা হয়েছে। রক্ষণাবেক্ষণ ও পুরোনো প্রযুক্তির কারণে তিনটি রাডার স্থায়ীভাবে অকেজো; ঢাকা ও রংপুরের রাডার সচল রয়েছে বলে চলতি দায়িত্বে থাকা পরিচালক মমিনুল ইসলাম জানান। তিনি বলেন, নতুন অর্গানোগ্রাম ও নীতিমালা অনুমোদিত হয়েছে এবং পদোন্নতি, নিয়োগ ও রাডার পুনঃস্থাপনের সমাধান দ্রুত হবে বলে আশা করা হচ্ছে।