আসন্ন ত্রয়োদশ জাতীয় সংসদ নির্বাচনকে ঘিরে হেফাজতে ইসলাম বাংলাদেশের নেতাকর্মীরা অন্তত চারটি ধারায় বিভক্ত হয়ে পড়েছেন। অরাজনৈতিক সংগঠন হিসেবে পরিচিত হলেও সংগঠনটির বহু নেতা বিভিন্ন রাজনৈতিক জোটের প্রার্থী হিসেবে নির্বাচনে অংশ নিচ্ছেন, আবার কেউ কেউ প্রকাশ্যে কোনো দল বা জোটের পক্ষে-বিপক্ষে অবস্থান নিয়েছেন। হেফাজতের আমির ও মহাসচিবসহ শীর্ষ নেতাদের জামায়াতবিরোধী বক্তব্য ঘিরে বিতর্কও সৃষ্টি হয়েছে।
প্রতিবেদন অনুযায়ী, ২০১০ সালে ইসলামবিরোধী কর্মকাণ্ডের বিরুদ্ধে কওমি মাদরাসা শিক্ষকদের নিয়ে গঠিত হয় হেফাজতে ইসলাম বাংলাদেশ। সংগঠনটি দীর্ঘদিন অরাজনৈতিক অবস্থান বজায় রাখলেও এর নেতারা বিভিন্ন সময়ে রাজনৈতিক দলের সঙ্গে ঘনিষ্ঠ সম্পর্ক রেখেছেন। এবারের নির্বাচনে কেউ বিএনপি নেতৃত্বাধীন জোটে, কেউ জামায়াত নেতৃত্বাধীন জোটে যুক্ত হয়েছেন। অন্যদিকে কওমি অঙ্গনের একটি বড় অংশ রাজনীতি থেকে দূরে থেকে নীরব ভূমিকা পালন করছে।
এই বিভক্তি হেফাজতের অনুসারী ও কওমি সমাজে অস্বস্তি সৃষ্টি করেছে। সংগঠনের নেতারা দাবি করছেন, রাজনৈতিক সম্পৃক্ততা ব্যক্তিগত পর্যায়ের, সাংগঠনিক নয়, যদিও বাস্তবে পরিস্থিতি আরও জটিল বলে জানা গেছে।