গোপালগঞ্জের কোটালীপাড়ায় শেখ হাসিনার জনসভার পাশে ২০০০ সালের জুলাই মাসে ৭৬ কেজি ওজনের বোমা উদ্ধারের ঘটনায় করা মামলায় মৃত্যুদণ্ডপ্রাপ্ত কয়েকজন আলেম এখনো কারাগারে রয়েছেন। মামলার প্রথম চার্জশিটে তাদের নাম না থাকলেও ২০০৯ সালে আওয়ামী লীগ ক্ষমতায় আসার পর তদন্ত কর্মকর্তারা তাদের অন্তর্ভুক্ত করেন। ২০১৭ সালে দ্রুত বিচার ট্রাইব্যুনাল মৃত্যুদণ্ডের রায় দেয় এবং ২০২১ সালে হাইকোর্ট তা বহাল রাখে।

মামলার নথি অনুযায়ী, রায়টি মুফতি হান্নানের জোরপূর্বক নেওয়া জবানবন্দির ওপর ভিত্তি করে দেওয়া হয়, যা পরবর্তীতে উচ্চ আদালত অবিশ্বাসযোগ্য ঘোষণা করে। আইনজীবী ও পরিবারের সদস্যরা দাবি করেছেন, রাজনৈতিক উদ্দেশ্যে আলেমদের মিথ্যা মামলায় জড়ানো হয়েছে এবং দীর্ঘসূত্রতার কারণে তারা এখনো বন্দি রয়েছেন। মানবাধিকার সংগঠনের প্রতিনিধিরা এ ঘটনাকে আলেমদের জঙ্গি হিসেবে প্রমাণের প্রচেষ্টা হিসেবে বর্ণনা করেছেন।

২০১৭ সালে মামলার নথি হাইকোর্টে পাঠানো হলেও বেঞ্চ পুনর্গঠনের কারণে শুনানি শুরু হয়নি। ফলে মৃত্যুদণ্ডপ্রাপ্ত আলেমরা বছরের পর বছর কারাগারে রয়েছেন এবং ন্যায়বিচারের অপেক্ষায় আছেন।