জুলাই গণঅভ্যুত্থানে আওয়ামী সরকারের পতনের পরও বাংলাদেশ পানি উন্নয়ন বোর্ডে (বাপাউবো) এখনো প্রভাব বিস্তার করছে বঙ্গবন্ধু প্রকৌশলী পরিষদ ও বঙ্গবন্ধু পরিষদের নেতারা। *আমার দেশ*–এর প্রতিবেদনে বলা হয়, সাবেক পানিসম্পদ সচিব কবির বিন আনোয়ারের ঘনিষ্ঠ কর্মকর্তারা এখনো গুরুত্বপূর্ণ পদে রয়েছেন এবং তার নির্দেশেই বদলি-পদায়ন হচ্ছে। পানিসম্পদ মন্ত্রণালয়ে পাঠানো এক নথিতে ৪০ জন কর্মকর্তার নাম উল্লেখ করা হয়েছে, যাদের বিরুদ্ধে আওয়ামী ফ্যাসিস্ট, সাবেক ছাত্রলীগ নেতা বা সংশ্লিষ্ট সংগঠনের সদস্য হওয়ার অভিযোগ রয়েছে।

ফ্যাসিবাদবিরোধী কর্মকর্তাদের অভিযোগ, বর্তমান মহাপরিচালক এনায়েত উল্লাহর নেতৃত্বে একটি শক্তিশালী সিন্ডিকেট এখনো সক্রিয় রয়েছে এবং বিরোধী কর্মকর্তাদের কোণঠাসা করে রাখা হয়েছে। প্রতিবেদনে দুর্নীতি, ক্ষমতার অপব্যবহার ও বিদেশি সংযোগের অভিযোগও উঠে এসেছে, যদিও অভিযুক্ত কয়েকজন এসব অভিযোগ অস্বীকার করেছেন।

বাপাউবোর সিবিএ নেতারা স্বীকার করেছেন যে কিছু আওয়ামী ঘনিষ্ঠ কর্মকর্তা এখনো বহাল আছেন, তবে তারা দাবি করেছেন সরকার ধীরে ধীরে তাদের অপসারণের পদক্ষেপ নিচ্ছে।